一、抗生素与畜禽粪便
为了治疗动物疾病和加速动物生长，每年有超过8000吨的抗生素被广泛用于畜禽养殖业，只有少量抗生素参与动物的新陈代谢而被有效利用，大部分抗生素及抗性基因随动物尿液和粪便排出体外，而畜禽粪便作为有机肥用于农业生产，可能造成土壤抗生素污染，危及农产品安全。动物粪便中残留的抗生素随施肥进入土壤后会被植物吸收并积累，并破坏植物根际周围的微生态平衡。抗生素污染目前已经成为国际上的研究热点之一、中国是一个农业大国，畜禽养殖业也逐步由分散式向集约式养殖方式转变，在经济利益的诱惑下，抗生素滥用比其他各国更为严重，因此，畜禽粪便造成的抗生素污染问题也更为突出。其中，尤以四环素类抗性基因和磺胺类抗性基因的检出最为常见，喹诺酮类抗性基因也被检出，但不多见。虽然畜禽粪便中抗生素会有部分残留，但谈抗生素“色变”也大可不必。
二、堆肥可降解抗生素
目前有没有降解畜禽粪便抗生素残留的方法?
堆肥即为处理各种废弃物使之无害化和资源化的一种有效途径，利用堆肥去除畜禽粪便中的有害污染物也能起到一定作用。通过在堆肥过程中添加抑制剂或者嗜热菌剂等改善堆肥条件，便可以在一定程度上防止抗生素抗性基因进入土壤环境，降低抗生素抗性基因这种新型环境污染物的含量。
在实际堆肥生产中，一般会选择添加调理剂来调节堆肥效果，比如锯末、稻草、秸秆等，具有较高的含碳量，在好氧堆肥特别是鸡粪堆肥中应用最为广泛。另外，通过加入嗜热菌剂等微生物菌剂也可显着提高堆体温度，延长高温持续的时间。堆肥可以明显降低粪便中抗生素浓度。
大部分畜禽粪便不经过堆肥处理直接施于农作物，抗生素抗性基因就会通过土壤环境进入农产品，甚至通过食物链进入人体，威胁人类的健康，而且抗生素是工业化、规模化养殖及动物预防疾病必须使用的，一时间很难从源头控制其使用。
三、畜禽粪便处理现状
据统计，目前，畜禽粪便的高效处理率仅30.1%，其中，传统堆沤畜禽粪便处理方式占比最大，为41.7%;工厂化堆肥和生产沼气分别占比16.5%和13.6%(高效处理率仅30.1%)；剩余28.2%处理与否、如何处理未知。
鉴于以上所述，可以考虑通过工厂化堆肥，利用堆肥过程中产生的高温有效去除抗生素基因，并迅速降解粪便中残留的抗生素。
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